lamindb

(★ 364)

Open-source data management for multimodal AI. Query, trace, and govern with a lineage-native, format-agnostic lakehouse for agents and teams. With support for biological formats and registries by the creators of Scanpy. 🍊YC S22

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- - bug_report.yml
  - config.yml
  - enhancement.yml
  - usage_question.yml
- - build.yml
  - doc-changes.yml
  - profile.yml
- - curate-any.md
  - keep-artifacts-local.md
  - pydantic-pandera.md
  - search.md
  - symbol-mapping.md
  - test_notebooks.py
  - track-run-inputs.md
- - curate_anndata_flexible.py
  - curate_anndata_uns.py
  - curate_dataframe_attrs.py
  - curate_dataframe_external_features.py
  - curate_dataframe_flexible.py
  - curate_dataframe_minimal_errors.py
  - curate_dataframe_union_features.py
  - curate_mudata.py
  - curate_soma_experiment.py
  - curate_spatialdata.py
  - define_schema_anndata_uns.py
  - define_schema_df_metadata.py
  - define_schema_spatialdata.py
  - my_workflow.py
  - my_workflow_with_click.py
  - my_workflow_with_step.py
  - run_script_with_step.py
  - run_track_and_finish.py
  - run_track_with_features_and_params.py
  - run_track_with_params.py
  - synced_with_git.py
- - add-replace-cache.ipynb
  - anndata-accessor.ipynb
  - prepare-sync-local-to-cloud.ipynb
  - sync-local-to-cloud.ipynb
  - test_notebooks.py
  - upload.ipynb
  - vitessce.ipynb
- acid.md
- api.md
- arrays.md
- bionty.md
- changelog.md
- curate.md
- design.md
- faq.md
- guide.md
- idempotency.md
- index.md
- lamindb.md
- manage-changes.md
- manage-ontologies.md
- organize.md
- pertdb.md
- query-search.md
- storage.md
- tables.md
- test_notebooks.py
- track.md
- transfer.md
- - __init__.py
  - dtypes.py
  - fields.py
  - ids.py
  - types.py
  - uids.py
  - users.py
  - utils.py
- - __init__.py
  - _compat.py
  - _context.py
  - _functions.py
  - _mapped_collection.py
  - _settings.py
  - _sync_git.py
  - _track_environment.py
  - _verify_lineage.py
  - exceptions.py
  - loaders.py
- - __init__.py
  - core.py
- - __init__.py
- - __init__.py
  - _croissant.py
  - _vitessce.py
  - lightning.py
- - 0177_squashed.py
  - 0178_v2_2.py
  - 0179_v2_2_part_2.py
  - 0180_v2_2_part_3.py
  - 0181_v2_2_part_4.py
  - 0182_v2_2_part_5.py
  - 0183_v2_2_part_6.py
  - 0184_alter_transformrecord_feature.py
  - 0185_alter_runrecord_feature.py
  - 0186_v2_4.py
  - 0187_v2_4_part_2.py
  - 0188_remove_record_prevent_record_type_cycle_and_more.py
  - 0189_v2_6.py
  - 0190_squashed.py
  - 0190_v2_6_1.py
  - 0191_artifactschema_unique_slot_schema.py
  - 0192_v2_9.py
  - 0193_v2_9_part_2.py
  - __init__.py
  - README.md
- - __init__.py
  - _describe.py
  - _django.py
  - _feature_manager.py
  - _from_values.py
  - _is_versioned.py
  - _label_manager.py
  - _lineage.py
  - _relations.py
  - _run_cleanup.py
  - _view.py
  - artifact.py
  - artifact_set.py
  - block.py
  - can_curate.py
  - collection.py
  - db.py
  - feature.py
  - has_parents.py
  - project.py
  - query_manager.py
  - query_set.py
  - record.py
  - record_set.py
  - run.py
  - save.py
  - schema.py
  - sqlrecord.py
  - storage.py
  - transform.py
  - ulabel.py
- - __init__.py
  - _merge.py
  - _switch.py
- .agents
- __init__.py
- _finish.py
- _secret_redaction.py
- errors.py
- py.typed
- migrate_test_instances.py
- bionty
- cellxgene-lamin
- lamin-cli
- lamindb-setup
- pertdb
- - conftest.py
  - test_cellxgene_curation.py
  - test_curate_from_croissant.py
  - test_curators_examples.py
  - test_curators_remote.py
  - test_dataframe_curation.py
- - conftest.py
  - test_lightning.py
- - test_import.py
- - conftest.py
  - test_connect_dynamic_import.py
  - test_import_side_effects.py
  - test_no_default_instance.py
  - test_verify_lineage.py
- - conftest.py
  - jwt_utils.py
  - test_rls_dbwritelog.py
- - import_lamindb.py
  - import_lamindb_and_connect.py
  - import_lamindb_core_storage.py
  - import_records_from_dataframe.py
- - _dataset_fixtures.py
  - conftest.py
  - test_artifact_anndata_with_curation.py
  - test_artifact_basics.py
  - test_artifact_dataframe_with_curation.py
  - test_artifact_describe_to_dataframe.py
  - test_artifact_features_annotations.py
  - test_artifact_parquet.py
  - test_blocks.py
  - test_branches.py
  - test_can_curate.py
  - test_collection.py
  - test_curator_basics.py
  - test_db.py
  - test_delete.py
  - test_feature.py
  - test_feature_dtype.py
  - test_from_values.py
  - test_has_parents.py
  - test_has_type.py
  - test_integrity.py
  - test_is_versioned.py
  - test_label_manager.py
  - test_load.py
  - test_manager.py
  - test_merge.py
  - test_nbconvert.py
  - test_notebooks.py
  - test_querydb.py
  - test_queryset.py
  - test_record_basics.py
  - test_record_sheet_examples.py
  - test_rename_features_labels.py
  - test_run.py
  - test_save.py
  - test_schema.py
  - test_search.py
  - test_settings.py
  - test_sqlrecord.py
  - test_storage.py
  - test_switch.py
  - test_track_flow.py
  - test_track_lineage.py
  - test_track_params.py
  - test_track_script_or_notebook.py
  - test_track_step.py
  - test_transfer.py
  - test_transform.py
  - test_transform_from_git.py
  - test_view.py
- - conftest.py
  - test_artifact_storage.py
  - test_artifact_zarr.py
  - test_cache.py
  - test_connect_reconnect.py
  - test_storage_lifecycle.py
  - test_streaming.py
- - conftest.py
  - test_artifact_basics.py
  - test_curators.py
  - test_storage.py
- - conftest.py
  - test_save_to_another_db.py
  - test_transfer.py
.gitignore
.gitmodules
.pre-commit-config.yaml
CONTRIBUTING.md
lamindb_full.py
LICENSE
noxfile.py
pyproject.full.toml
pyproject.toml
README.md

# 설치 가이드

1. 코드 내려받기

git clone https://github.com/laminlabs/lamindb

깃허브에서 프로젝트 코드 전체를 내 컴퓨터로 내려받습니다.

cd lamindb

방금 내려받은 프로젝트 폴더 안으로 이동합니다.

2. 공식 설치 스크립트

쉬움 추천

사전 준비물

Python 3 pip 명령어를 쓰려면 Python이 필요합니다.

pip install lamindb

PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.

pip install lamindb-core

PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.

✅ 설치 후 새 터미널을 열고, 프로그램의 버전 확인 명령(예: --version)으로 정상 설치됐는지 확인하세요.

이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.

3. Python

쉬움

사전 준비물

Git GitHub에서 프로젝트 코드를 내려받으려면 필요합니다.
Python 3 설치 시 'Add Python to PATH' 옵션을 꼭 체크하세요 (Windows).

pip install lamindb

PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.

pip install lamindb-core

PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.

✅ 에러 메시지 없이 실행되고 터미널에 안내 문구가 출력되면 정상입니다.

이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.

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2. 공식 설치 스크립트

3. Python

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3. Python

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