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# 生物统计学与R手册

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文档介绍
===============
该文档是生物统计学知识与相应R应用的手札，整合了生物统计学老师课件、网络博文资源以及部分个人见解。它既不是全面介绍生物统计学知识及原理、公式推导的专业书籍，也是不介绍R语言编程、操作原理的手册。

它适用于在有基本概率知识结构的基础上，回顾和把控生物统计学的基本知识脉络，以及了解如何用R做相应的分析。具体的实战应当参考文档中提供的参考链接或专业手册。

下载
=================
文档下载链接：[生统与R手札_v1.2](https://github.com/ShixiangWang/Handbook_of_biostatistic_R/releases/tag/1.2)

下载压缩包中包含手札的pdf版本，网页html版本，它都包含了所有内容，另外提供了一个常用概率公式文档（来自百度文库）。

新增中科院2015考题、数据、以及解答，有相关练习或参考需求的可以点击一下链接地址下载——[生统与R手札+中科院考题解析](https://github.com/ShixiangWang/Handbook_of_biostatistic_R/blob/master/Handbook_of_biostatistics_R.zip)

![preview1](https://raw.githubusercontent.com/ShixiangWang/Handbook_of_biostatistic_R/master/preview1.png)

（感谢@吴曼提供的R脚本与相关资料）

手札目录

Introduction
    参数检验与非参数检验
        假设检验的步骤
        单样本参数校验
        类型1和类型2错误
        两样本参数检验
        非参数检验
        多重检验矫正
    方差分析
        单因素方差分析
        KW检验
        两因素方差分析
        随机效应模型两因素方差分析
        混合模型两因素方差分析
        小结
        缺失值处理
    回归分析
        线性回归
        非线性回归
        相关分析
        多元线性回归
        逻辑回归
        偏相关与多重相关
    基因表达与富集分析
        差异表达基因分析
        富集分析
    PCA与聚类分析
        PCA
        聚类分析
    生存分析

[内容预览](https://github.com/ShixiangWang/Handbook_of_biostatistic_R/blob/master/Handbook%20of%20Biostatistics%20and%20R.md)
github的markdown不支持LeTex，所以相应公式显示不出来。

PDF版本
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提供目录，并支持所有标题的书签，显示LeTex语法编辑的公式。方便对特定知识内容的查询。

HTML网页
----------------------
提供目录，显示LeTex语法编辑的公式，连续可读性比PDF好。注意不要移动或删除压缩包目录下的/pic文件夹，不然无法显示图片。如果处于无网络状态打开该网页，可能最后几个章节的部分图片无法正常加载。

问题反馈与交流
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个人知识与能力有限，难免出现问题或者错误。如果发现错误或者有疑问，可以在发布该文档的地址评论或留言，也可以在<https://github.com/ShixiangWang/Handbook_of_biostatistic_R/issues>发布一个`New issue`，我会尽量及时更正或者回答。

共享与编辑
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06-15-2017

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