vcfanno

(★ 404)

annotate a VCF with other VCFs/BEDs/tabixed files

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최종 버전 다운로드 (.zip)

- - ci.yml
  - release.yml
- ISSUE_TEMPLATE.md
- api.go
- api_test.go
- README.md
- reducers.go
- reducers_test.go
- regr_test.go
- - cadd.md
  - clinvar_exac.conf
  - clinvar_exac.lua
  - clinvar_exac.md
- - vcfanno-overview-final.png
- CHANGES.md
- index.md
- performance_tips.md
- conf.toml
- custom.lua
- ex.bam
- ex.bam.bai
- exac.vcf.gz
- exac.vcf.gz.tbi
- fitcons.bed.gz
- fitcons.bed.gz.tbi
- gem.conf
- gnomad.conf
- query.vcf.gz
- rare-disease.conf
- rare-disease.lua
- - 1kg.times-tails.fmt.txt
  - afci.lua
  - chunk-gap-plot.py
  - compare.toml
  - custom.lua
  - exac.times-tails.txt
  - example.conf
  - example.lua
  - example.sh
  - gap-plot.py
  - gaps.sh
  - gem.conf
  - genotypes-1kg.sh
  - par-times.txt
  - parallelization-figure.py
  - parallelization-run.sh
  - README.md
  - timing-plot.py
  - timing.py
  - vcfsort.sh
- test-anno.py
- shared.go
- - astar.anno.vcf.gz
  - astar.anno.vcf.gz.tbi
  - astar.conf
  - astar.vcf
- - annotation.tsv.gz
  - annotation.tsv.gz.tbi
  - conf.toml
  - q.vcf
- - conf.toml
  - dummyexons.bed.gz
  - dummyexons.bed.gz.tbi
  - test.vcf
- - multiple-alts.conf
  - multiple-alts.vcf.gz
  - multiple-alts.vcf.gz.tbi
  - number-input.vcf
  - number.conf
  - number.vcf.gz
  - number.vcf.gz.tbi
- - Calls_for_dbNSFP_example.vcf.gz
  - conf.toml
  - dbNSFP_ex.txt.gz
  - dbNSFP_ex.txt.gz.tbi
  - dbNSFP_example.txt.gz
  - dbNSFP_example.txt.gz.tbi
- - cosmic.small.vcf.gz
  - cosmic.small.vcf.gz.tbi
  - dbsnp.small.vcf.gz
  - dbsnp.small.vcf.gz.tbi
  - small.ann.vcf
  - small.toml
  - small.vcf.gz
  - small.vcf.gz.tbi
  - some.lua
- - o.conf
  - o.lua
  - o.vcf
- - ma-db.vcf.gz
  - ma-db.vcf.gz.tbi
  - ma-query.vcf
  - ma.conf
- - a.conf
  - gno.vcf.gz
  - gno.vcf.gz.tbi
  - notbgz.vcf.gz
- - tmp_annotation.txt.gz
  - tmp_annotation.txt.gz.tbi
  - tmp_annotations.toml
  - tmp_calls.vcf.gz
  - tmp_calls.vcf.gz.tbi
- - test-gnomad.vcf.gz
  - test-gnomad.vcf.gz.tbi
  - test-input.vcf
  - vcfanno.config
- find-out-of-order.py
- functional-test.sh
- release-tests.sh
.gitignore
bench_test.go
go.mod
go.sum
LICENSE
Makefile
mkdocs.yml
README.md
vcfanno.go

# 설치 가이드

1. 코드 내려받기

git clone https://github.com/brentp/vcfanno

깃허브에서 프로젝트 코드 전체를 내 컴퓨터로 내려받습니다.

cd vcfanno

방금 내려받은 프로젝트 폴더 안으로 이동합니다.

2. Go

보통 추천

사전 준비물

Git GitHub에서 프로젝트 코드를 내려받으려면 필요합니다.
Go Go 언어 컴파일러 및 도구 모음입니다.

go build ./...

Go 프로그램을 컴파일해 실행 파일을 만듭니다.

go run .

따로 빌드하지 않고 바로 Go 프로그램을 실행합니다.

✅ 빌드가 에러 없이 끝나면 성공입니다. go run . 을 썼다면 터미널 출력을 확인하세요.

3. Make

보통

사전 준비물

Git GitHub에서 프로젝트 코드를 내려받으려면 필요합니다.
Make Linux/macOS는 보통 기본 설치되어 있습니다. Windows는 별도 설치(예: MSYS2, WSL)가 필요합니다.

make

생성된 빌드 설정을 바탕으로 실제 컴파일을 진행해 실행 파일을 만듭니다.

✅ 에러 없이 끝나면 성공입니다. 생성된 실행 파일을 직접 실행해보세요.

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